Новая станция работает в двух диапазонах: 136–174 и 400–470 МГц, а выходная мощность достигает 5 Ватт. Она оснащена большим дисплеем и клавиатурой с четырьмя клавишами быстрого доступа. Уровень шумоподавления настраивается через меню. Рация снабжена FM-приемником, а мощный динамик на 1 Вт обеспечивает высокое качество звука.
При подключении гарнитуры Yaesu FT-65R может активироваться голосом, без нажатия кнопки PTT. Рация имеет функции сканирования памяти, приоритетного сканирования каналов, оснащена системой ARTS (отслеживание доступности радиоэфира), поддерживает коды CTCSS/DCS, DTMF, может ограничивать время передачи, блокировать занятый канал и отключаться автоматически. Рация также может производить сканирование погодных каналов. Программирование Yaesu FT-65R осуществляется с ПК. Возможно клонирование между радиостанциями.
В лучшую сторону Yaesu FT-65R отличает и появление шага 6,25, который необходим для работы на PMR-частотах. Заряжать рацию также стало проще: легкий Li-Ion аккумулятор емкостью 1950 мАч можно заряжать не дожидаясь окончания цикла «заряд-разряд». Благодаря ему вес рации уменьшился. Рация оснащена светодиодом, который можно использовать в качестве фонарика, подающего аварийный сигнал. Пыле- и влагозащищенный, ударопрочный корпус соответствует стандартам IP-54 и MIL-810 C, D, E.